Lincoln bot das Aviator-Typenschild erstmals in den frühen 2000er Jahren auf einem großen dreireihigen SUV an, aber der mangelnde Erfolg des Modells führte dazu, dass es nach weniger als vier Jahren auf dem Markt aus der Produktion genommen wurde.
Mehr als ein Jahrzehnt später erkannte Lincoln, dass es so vernarrt in den Spitznamen Aviator ist, dass es einen brandneuen SUV entwickelte, um ihn noch einmal zu tragen. Genau wie sein Vorgänger ist der brandneue Aviator ein mittelgroßer dreireihiger SUV, der in der modernen SUV-Reihe von Lincoln direkt unter dem Navigator sitzt.

Während V8-Saugmotoren Anfang der 2000er Jahre bei amerikanischen Mittelklasse- und Oberklasse-SUVs üblich waren, verfügt der Lincoln Aviator der zweiten Generation über eine Motorenpalette, die nur Sechszylinder mit zwei Turboladern umfasst. Das Einstiegsmodell wird von einem 3,0-Liter-V6 mit zwei Turboladern mit 400 PS und 400 lb-ft Drehmoment angetrieben, der über ein von Ford entwickeltes 10-Gang-Automatikgetriebe auf alle vier Räder übertragen wird. Das Spitzenmodell ist eine Plug-in-Hybridversion, die eine eigene Nomenklatur (Aviator Grand Touring) erhält und mit 450 PS und nicht weniger als 600 lb-ft Drehmoment ausgestattet ist, während sie viel weniger Kraftstoff verbraucht als das Standardmodell. Während das Äußere des Modells der gleichen Designsprache folgt wie sein größerer Bruder, der Navigator, jedoch mit mehr aeronautischen Einflüssen, hat das Innere einen eigenen Stil.

Der mittelgroße Lincoln Aviator SUV, der zwischen 2003 und 2005 produziert wurde und auf der Ford U-Plattform basiert, wird von einem modularen 4,6-Liter-DOHC-V8-Benzinmotor mit elektronischer Einspritzung mit 302 PS und 300,2 Pfund-Fuß Drehmoment angetrieben. Das Getriebe bestand aus einem 5-Gang-Automatikgetriebe, während der Hinterradantrieb Standard war. Optional können sich Kunden für ein Allradantriebssystem für eine bessere Leistung in unwegsamem Gelände entscheiden. Als überarbeiteter Mercury Mountaineer und Ford Explorer, der in geringen Stückzahlen verkauft wurde, beendete der Aviator die Produktion, als die beiden anderen Modelle für 2006 neu gestaltet wurden.