Der spanische Autohersteller verwarf die ursprünglichen Pläne, den Exeo nur unter einer Karosserieform, nämlich der Limousine, zu vermarkten, und brachte im August 2009 die ST-Version (Sport Tourer) auf den Markt.
Der Exeo ST verfügt über die gleiche Motorenpalette wie die Limousinenversion, mit dem einzigen Unterschied, dass der Innenraum größer ist. Mit dem neuen Exeo ST stellt Seat das WIV-System zur Verfügung. Es informiert den Fahrer, wenn das Auto gewartet werden muss, wenn der Motor zu wenig Öl hat oder wenn die Bremsen verschlissen sind. Dank des WIV-Systems hat Seat die Gangempfehlungsfunktion eingeführt, die bei jeder Geschwindigkeit den passenden Gang für den optimalen Kraftstoffverbrauch vorschlägt.