Lincoln ofreció por primera vez la placa de identificación Aviator en un SUV grande de tres filas a principios de la década de 2000, pero la falta de éxito del modelo hizo que dejara de fabricarse después de menos de cuatro años en el mercado.
Más de una década después, Lincoln se dio cuenta de que estaba tan enamorado del apodo Aviator que desarrolló un nuevo SUV para usarlo una vez más. Al igual que su predecesor, el nuevo Aviator es un SUV de tres filas de asientos de tamaño mediano que se ubica justo debajo del Navigator en la línea de SUV modernos de Lincoln.

Si bien los V8 de aspiración natural eran una característica común en los SUV medianos y grandes estadounidenses a principios de la década de 2000, la Lincoln Aviator de segunda generación tiene una línea de motores que solo comprende seis cilindros con doble turbocompresor. El modelo de nivel de entrada está propulsado por un V6 de 3.0 litros con doble turbocompresor con 400 caballos de fuerza y 400 libras-pie de torque, enviado a las cuatro ruedas a través de una transmisión automática de 10 velocidades desarrollada internamente por Ford. El modelo tope de gama es una versión híbrida enchufable que tiene su propia nomenclatura (Aviator Grand Touring), y viene con 450 caballos de fuerza y no menos de 600 libras-pie de torque mientras usa mucho menos combustible que el modelo estándar. Mientras que el exterior del modelo sigue el mismo lenguaje de diseño que su hermano mayor, el Navigator, pero con influencias más aeronáuticas, el interior tiene su propio estilo.

El SUV Lincoln Aviator de tamaño mediano, en producción entre 2003 y 2005 y basado en la plataforma Ford U, está propulsado por un motor de gasolina de inyección electrónica Modular V8 DOHC de 4.6L con 302 HP y 300.2 lb/ft de torque. La transmisión consistía en una caja de cambios automática de 5 velocidades, mientras que la tracción trasera era estándar. Opcionalmente, los clientes podían optar por un sistema de tracción total para un mejor rendimiento en terrenos irregulares. Al ser un Mercury Mountaineer y un Ford Explorer rebautizados, y venderse en volúmenes bajos, el Aviator salió de la producción cuando los otros dos modelos se rediseñaron para 2006.