Poco después de romper sus lazos con Ford, Mazda comenzó a reconstruir toda su línea, y el Mazda 3 2009 fue una gama importante.
El Mazda 3 2009 se basó en el modelo anterior, desarrollado junto con Ford. Pero los cambios que trajo para el modelo fueron extensos e importantes.

El aspecto exterior estaba en la filosofía de diseño Zoom-Zoom de los japoneses. Tenía el aspecto de un sedán deportivo compacto y la plataforma para respaldarlo. Algunas de las mejoras importantes con respecto a la generación anterior fueron la introducción de serie del ABS en toda la gama, comenzando desde el nivel de equipamiento base. Para el sedán, se agregó un abridor de baúl con control remoto, para complementar el método de apertura con llave. El sedán Mazda 3 ofrecía un faro bixenón autonivelante con el sistema de iluminación frontal adaptable. Fue el primer sedán de clase compacta en ofrecer un sistema tan avanzado.

En el interior del vehículo se instaló un nuevo salpicadero con materiales de mayor calidad. Algunos de los botones y controles se reorganizaron para mejorar la ergonomía. Se instaló una pantalla de información múltiple en la parte superior de la consola central. Incluía información de navegación, audio y computadora de viaje.

Para el mercado estadounidense, el Mazda 3 Sedan ofrecía dos opciones de motor, mientras que en Europa el automóvil se ofrecía con una opción más amplia, tanto diésel como gasolina. En el continente norteamericano, el Mazda 3 se equipó de serie con transmisión automática en la parte superior, motor de 2,5 litros.