Tres años después de presentar el modelo familiar de Córdoba, el fabricante de automóviles español presentó la versión renovada de toda la gama.
Si bien la versión familiar no necesitó una actualización después de solo tres años, el resto de la gama sí lo hizo porque ya tenía seis años. Cuando SEAT lanzó la gama Córdoba en 1993, no tenía suficiente dinero para construir una gama completa, por lo que tuvo que esperar otros tres años para presentar su familiar de segmento pequeño. Cuando se lanzó, su aspecto ya era antiguo, y la actualización de 1999 solucionó eso.

El modelo de 1999 presentaba bordes más suaves y algunas líneas curvas sobre la carrocería. Sus faros lucían una curva en la parte superior, mientras que su antecesor los presentaba rectangulares. En busca de su imagen de marca, el fabricante de automóviles introdujo una nueva insignia en la parte delantera, rodeada por un marco del color de la carrocería. El parachoques era nuevo y presentaba faros antiniebla cuadrados en lugar de redondos. SEAT presentó las manijas de las puertas del color de la carrocería, mejorando el aspecto de la vista lateral. En la parte trasera, el fabricante de automóviles cambió el parachoques y agregó una banda de goma negra.

En el interior, el fabricante de automóviles introdujo un tablero completamente nuevo con una mejor integración para el sistema de ventilación y ventilaciones suaves en la parte superior de la consola central. Dentro del grupo de instrumentos, SEAT adoptó el estilo de Volkswagen para los diales, con los indicadores de temperatura y combustible instalados en el medio y en la parte superior del panel.

SEAT ofreció el Córdoba con siete motorizaciones, tanto de gasolina como diésel, que oscilaban entre los 68 CV y los 110 CV. Todos los motores se combinaron con un manual de cinco velocidades.

Seat presentó la primera generación del Cordoba en 1993 y, tres años después, estaba disponible en versión familiar, denominada Vario.
Después de lanzar con éxito la segunda generación de la línea Ibiza, el fabricante de automóviles español presentó una versión de tres cajas llamada Córdoba. Compartieron la misma plataforma con el Polo. Pero el fabricante de automóviles alemán, que ya era dueño de la marca española, decidió posponer la versión familiar y lanzarla en 1996 junto con la versión renovada para toda la gama Córdoba.

En el exterior, la camioneta de segmento pequeño presentaba faros horizontales tipo Polo y una parrilla que parecía una sonrisa. Era su forma de mostrar un coche que podía mejorar la vida de las personas. El tiempo de las camionetas no había pasado, y un vehículo con suficiente espacio interior como un vehículo de tamaño compacto era una buena noticia. Si bien la parte delantera del automóvil era similar a la del Cordoba de tres cajas, después del pilar B, los diseñadores hicieron un techo más extendido y, detrás de los pilares C, colocaron un juego de ventanas cuadradas. No era una obra de arte muy imaginativa. Más como un trabajo de “pongámosle una mochila a esta cosa”. En la parte trasera, la camioneta presentaba una franja roja que conectaba las luces traseras montadas verticalmente.

En el interior, había un diseño de tablero sencillo, con una consola central que caía hacia el piso y un grupo de instrumentos pequeño y redondeado con diales VW Polo ligeramente rediseñados. Sus asientos delanteros eran sencillos y estaban montados bajos en la base para crear una sensación deportiva. En la parte trasera, el banco plegable era adecuado para dos pasajeros de tamaño adulto.

Debajo del capó, el Cordoba Vario más notorio estaba equipado con el nuevo motor diesel de 1.9 litros, turbocargado o no, del contenedor de repuestos de Volkswagen. Aparte de eso, el fabricante de automóviles ofreció el Cordoba Vario con una selección de tres motores de gasolina.