En 2004, l’Audi A3 a reçu une mise à jour, avec une toute nouvelle partie avant, une grande calandre, des phares rafraîchis, de nouveaux pare-chocs et de nouvelles roues et finitions extérieures.
Sa version cinq portes a été nommée Sportback juste pour la différencier de la version trois portes, nommée hatchback.

La deuxième génération de l’Audi A3 a été lancée au Salon de l’automobile de Genève en 2003. Elle était basée sur une nouvelle plate-forme et, en juin 2004, la version Sportback à cinq portes a été introduite sur le marché. Sur le segment des voitures à hayon, la Sportback était la seule voiture haut de gamme à offrir cinq portes. La BMW Série 3 Compact et la Mercedes-Benz Sportcoupe n’étaient disponibles qu’en versions trois portes.

Il y avait un nouveau design signé par Walter da Silva mais il comportait la nouvelle calandre introduite pour la première fois sur l’Audi A8 W12. Par rapport à la version 3 portes, l’A3 Sportback était plus longue de 80 mm (3,14”) en raison d’un empattement plus long. Sur le toit, le client pouvait choisir une paire de rails de toit argentés. L’arrière avait reçu un nouveau pare-chocs et des feux arrière de style A4. Son troisième feu stop était installé sur le petit becquet de toit.

A l’intérieur, il y avait de la place pour cinq passagers. Il s’agissait d’un véhicule compact haut de gamme doté d’équipements haut de gamme tels que la climatisation automatique et une nouvelle transmission semi-automatique. Des sièges en cuir et des sièges baquets sport étaient proposés en option ou de série sur des modèles spécifiques.

Par rapport à ses rivales, l’A3 Sportback était disponible avec des systèmes de traction intégrale.