A Lamborghini Engineering SpA desenvolveu um kit especial para o Diablo SE30 e o nomeou Jota em homenagem ao Miura original construído para cumprir os regulamentos de corrida do Apêndice J da FIA.
Nos anos 90, a Lamborghini tentou entrar na Fórmula 1 e vencer a Scuderia Ferrari em seu próprio jogo, mas acabou em um fracasso total e, sem vitórias nem dinheiro para queimar, eles tiveram que desistir. Na mesma época, seus engenheiros de corrida trabalharam em um kit especial, que recebeu o nome de Jota, em homenagem ao Miura Jota. Eles o instalaram no SE30, que já era uma versão mais leve do Diablo, e resultou no Lamborghini mais rápido já construído até aquela data. A montadora construiu apenas 28 kits, e 12 deles foram instalados em sua fábrica.

Como a versão do Jota foi baseada no modelo Special Edition 30, manteve a maioria dos recursos dessa versão. Havia um para-choque com quatro faróis de neblina na frente, enquanto nas laterais o carro apresentava pequenos segmentos de janelas rolantes e o tanque de combustível no lado do passageiro. O kit Jota veio com uma importante atualização sobre a tampa do motor. A equipe de engenharia introduziu entradas de ar especiais acima do teto do carro. Na traseira, a Lamborghini instalou uma asa ajustável.

No interior, o SE30 Jota apresentava dois materiais principais: fibra de carbono e Alcântara. Como era um supercarro leve, não tinha vidros elétricos. Havia apenas duas pequenas áreas que poderiam ter sido roladas manualmente por meio de uma maçaneta na porta. Para o painel de instrumentos, a Lamborghini instalou mostradores brancos em vez de pretos no restante da linha Diablo.

A Lamborghini Engineering modificou o motor e aumentou a potência do V-12 para 600 hp. Foi instalada uma caixa manual de seis velocidades.