A Lincoln ofereceu pela primeira vez a placa de identificação Aviator em um grande SUV de três linhas no início dos anos 2000, mas a falta de sucesso do modelo o tirou de produção após menos de quatro anos no mercado.
Mais de uma década depois, Lincoln percebeu que está tão apaixonado pelo apelido de Aviador que desenvolveu um novo SUV para usá-lo mais uma vez. Assim como seu antecessor, o novo Aviator é um SUV de três fileiras de tamanho médio que fica logo abaixo do Navigator na linha de SUVs modernos da Lincoln.

Enquanto os V8 naturalmente aspirados eram comuns nos SUVs de médio e grande porte americanos no início dos anos 2000, a segunda geração do Lincoln Aviator tem uma linha de motores que compreende apenas seis cilindros com turbocompressor duplo. O modelo de entrada é alimentado por um V6 de 3,0 litros com turbo duplo com 400 cavalos de potência e 400 lb-ft de torque, enviado às quatro rodas por meio de uma transmissão automática de 10 velocidades desenvolvida internamente pela Ford. O modelo topo de linha é uma versão híbrida plug-in que recebe sua própria nomenclatura (Aviator Grand Touring), e vem com 450 cavalos de potência e nada menos que 600 lb-ft de torque usando muito menos combustível do que o modelo padrão. Enquanto o exterior do modelo segue a mesma linguagem de design do seu irmão maior, o Navigator, mas com mais influências aeronáuticas, o interior tem um estilo próprio.

O SUV Lincoln Aviator de tamanho médio, em produção entre 2003 e 2005 e baseado na plataforma Ford U, é alimentado por um motor a gasolina de injeção eletrônica modular DOHC V8 de 4,6 litros com 302 HP e 300,2 libras-pés de torque. A transmissão consistia em uma caixa automática de 5 velocidades, enquanto a tração traseira era padrão. Opcionalmente, os clientes podem optar por um sistema de tração nas quatro rodas para um melhor desempenho em terrenos acidentados. Sendo um Mercury Mountaineer rebatizado e um Ford Explorer, e vendendo em volumes baixos, o Aviator saiu da produção quando os outros dois modelos foram redesenhados para 2006.