O Lincoln MKT 2013 foi uma evolução do modelo inicial de 2010, com novos recursos e novas mudanças de design para aprimorar o veículo como uma atualização de meia-vida.
A linha de SUVs Lincoln foi aprimorada mais uma vez para 2013 e, mesmo tendo como base a plataforma do Ford Edge, trazia comodidades exclusivas da luxuosa marca americana. As três fileiras de assentos foram cobertas com couro e a aparência geral do interior foi dominada por itens luxuosos.

As diferenças mais notáveis foram na grade, que foi redesenhada. Outra característica que aumentou o conforto e a sensação de arejamento dentro da cabine foi o teto panorâmico de classe fixa.

O interior foi fortemente modificado. Pode ser configurado como 6 ou 7 lugares sentados, com bancos individuais na fila do meio ou um banco. Os bancos da segunda fila também podem ser aquecidos e refrigerados. O refrigerador da segunda fila (integrado no console central) permaneceu uma opção popular. A instrumentação totalmente nova apresentava um velocímetro central ladeado por duas telas LCD coloridas. As telas LCD de 4,2 polegadas eram controladas por botões de cinco direções no volante. A tela de toque LCD multifuncional de 8 polegadas dominou a pilha central e forneceu a interface visual e de controle para o sistema de entretenimento, telefone, navegação e controle climático.

O motor padrão para 2013 era um V6 de 3,7 litros mais potente e eficiente, que oferecia uma potência aumentada de 268 para 300. A transmissão padrão era automática de 6 velocidades.