O nome do Lincoln Zephyr remonta ao final dos anos 30, quando foi construído como um sedã de luxo, e o modelo de 2005 visava o mesmo segmento.
Enquanto um V12 não o alimentava como seu ilustre predecessor, o Zephyr 2006 oferecia mais conforto e potência do que isso. A Ford construiu o Zephyr na mesma plataforma do Mazda 6, mas com uma distância entre eixos maior para proporcionar mais conforto aos passageiros traseiros.
A grade frontal cromada exagerava seu visual em cunha com ripas verticais na frente e os faróis angulares. O carro apresentava amplas lanternas traseiras divididas entre os painéis traseiros e a tampa do porta-malas na parte de trás. Talvez sua longa cabine parecesse muito conservadora, mas de fato serviu ao propósito de acomodar confortavelmente cinco passageiros.
No interior, o Zephyr apresentava um painel de instrumentos quase vertical com um visual elegante e saídas de ar circulares. A Lincoln instalou um sistema de infotainment de 10 alto-falantes com tela sensível ao toque e um CD player desenvolvido em conjunto com o especialista THX na pilha central. Os acabamentos em alumínio e madeira deixaram o carro muito elegante. Havia espaço para cinco na traseira, graças a um túnel de transmissão mais baixo, usado nas versões com tração nas quatro rodas. Seu encosto 60/40 dobrável para o banco traseiro permitiu um aumento para o porta-malas já de tamanho impressionante.
Sob a carroceria, o Zephyr apresentava suspensão independente em todos os cantos. Seu motor V-6 fornecido pela Ford apresentava um sincronismo variável da árvore de cames e foi emparelhado com uma transmissão automática padrão de seis velocidades.
