Em 2007, Mercedes-Benz e AMG comemoraram 40 anos de parceria.
Para comemorar isso, o CL foi presenteado com um modelo especial: o CL65 oferecido também como uma edição de 40º aniversário.

O CL65 AMG era um grande veículo Gran Tourer construído como a versão cupê para o Classe S. Embora não compartilhasse o mesmo visual, foi construído para os mesmos clientes. Para quem queria viajar com o mesmo luxo, mas com eles atrás do volante, não atrás do motorista.

O CL65 apresentava um capô longo e um teto aerodinâmico inclinado para trás. O design dos faróis duplos foi iniciado com o Classe E no final dos anos 90 e foi adotado pelo Classe C, CLK e CL, mas não no Classe S. O carro não apresentava um pilar B e fazia o carro parecer um falso cabriolet quando as janelas dianteiras e traseiras eram abaixadas. Nos para-lamas dianteiros, o carro apresentava emblemas V12 Biturbo cromados com

O interior foi equipado com materiais da mais alta qualidade e as mais recentes tecnologias disponíveis na época. Havia uma nova unidade de infoentretenimento premium com sistema de navegação e som premium. Os bancos de couro eram aquecidos e resfriados. Apesar de ser um carro muito potente, não estava equipado com acabamentos em fibra de carbono, mas sim com veios de madeira. O painel de instrumentos apresentava um design avançado com agulhas flutuantes. No tacômetro, o AMG V12 Biturbo foi mostrado em letras brancas.

Sob o capô, havia um grande motor bi-turbo de 6,0 litros. Foi limitado a 1000 Nm (737 lb-ft) de torque porque esse era o máximo que a caixa de câmbio 5G-Tronic poderia suportar. O 7G-Tronic estava disponível em outros modelos CL, mas não suportava esse torque enorme. Foi produzido em apenas 777 unidades antes de ser retirado do mercado.