A Audi lançou a segunda geração do A3 em 2003, e apenas um ano depois, em junho de 2004, apresentou a versão de cinco portas que veio com uma leve mudança na frente.
A versão de cinco portas foi introduzida na meia-idade da primeira geração do A3, depois que a Audi entendeu que seus clientes o comprariam, e eles o fizeram. O carro foi um grande sucesso. Mas a segunda geração começou com vendas lentas, e a montadora alemã teve que fazer algo rápido para consertar isso.
Em 2004, juntamente com a introdução do Audi A3 Sportback (a versão de cinco portas), a montadora mudou a frente do carro. A grade de quadro único ficou mais alta e os novos faróis pareciam mais atraentes. Ambos os pára-choques tiveram de ser alterados para se adequarem ao novo estilo. A versão de cinco portas também era mais comprida em 80 mm (3,14”) para acomodar os passageiros traseiros. Mas não havia muito espaço para o espaço para as pernas e para a cabeça. Como a maioria dos carros com facelift, as lanternas traseiras foram modificadas.
O interior foi dominado pela qualidade Audi, mas também por cores escuras e acabamentos prateados. Em termos de layout lógico, tudo estava onde você esperaria estar, mas não tinha o apelo de um Alfa 147. O A3 era considerado um Volkswagen Golf premium por ser baseado na mesma plataforma.
Todos os veículos tiveram que cumprir os motores Euro 4 a partir de 2005, e essa foi a principal mudança para a linha Audi A3 de 2005. A versão base foi equipada com uma unidade de 1,6 litro a gasolina naturalmente aspirada que oferecia apenas 102 cv. Para os ventiladores a diesel, a base era a unidade TDI de 1,9 litro. A maioria dos carros equipados com motores a diesel estavam sujeitos ao escândalo Dieselgate.