A Volkswagen apresentou a terceira geração do Polo em 1994 e, no ano seguinte, a montadora alemã apresentou a versão station wagon e, em 2000, renovou toda a linha.
O pequeno Polo deixou de ser o menor membro da família Volkswagen e continuou a aumentar de tamanho. Com um lançamento bem-sucedido para a forma de station wagon, a montadora alemã decidiu continuar a oferecê-la após a atualização do ciclo de vida de 2000.

Houve apenas pequenas modificações para o Polo Variant 2000 apenas olhando para o carro em comparação com sua versão sem facelift. No entanto, a Volkswagen afirmou que apenas 30% do carro permaneceu o mesmo de antes. Devido às novas regulamentações de poluição, as montadoras tiveram que usar cores à base de água, o que enfraqueceu os tratamentos antiferrugem. Para evitar isso, o Polo recebeu tratamento totalmente galvanizado. Além disso, havia novos faróis e lanternas traseiras, que deram ao Polo de tamanho pequeno uma aparência mais premium. Ambos os para-choques também foram redesenhados e ficaram um pouco maiores para diminuir os custos de reparo para acidentes abaixo de 5 km/h (3 mph).

Por dentro, há um novo design inspirado no irmão menor do carro, o VW Lupo, mas com materiais melhores. Seu painel de instrumentos, por exemplo, apresentava um estilo binocular para o velocímetro e tacômetro, com um LCD na parte inferior de cada mostrador. Acima deles, centralizados, a montadora colocou os medidores de combustível e temperatura. O proprietário poderia aumentar o tamanho do porta-malas de 390 litros (13,8 pés cúbicos) para 1.250 litros (44,1 pés cúbicos) rebatendo completamente os bancos traseiros.

Sob o capô, a Volkswagen instalou a mesma linha de motores do restante da linha Polo. Sua potência variou entre 75 cv e 100 cv.

A Volkswagen realmente não precisava de uma perua menor, pois tinha o Golf e o Passat para cobrir a maior parte do mercado, mas era barato para eles e os resultados eram bons.
No final dos anos 90, a quota de mercado das carrinhas diminuiu, mas ainda havia alguma procura por esse veículo. A Volkswagen já tinha uma boa plataforma no Polo. Assim, permitiu-lhes aumentar o lucro da mesma base e, depois do sedã, hatchback com três e cinco portas, o station-wagon foi o próximo passo lógico.

Até o pilar B, o Polo Variant se parecia com a versão de 5 portas. Enquanto a maioria de seus concorrentes já começava a adoçar as linhas do carro com mais curvas impostas pela tendência do biodesign, a Volkswagen decidiu apenas suavizar as arestas. Era um veículo de função de seguimento de forma sem muita imaginação em sua aparência. A porta traseira era extraordinariamente larga para um carro de sua classe, e as pequenas lanternas traseiras foram montadas logo acima do para-choque traseiro, nos pilares D.

Por dentro, o Polo Variant apresentava o mesmo painel do restante de sua linha, com um pequeno painel de instrumentos arredondado. O hodômetro não estava mais em um contador comum, mas exibido em um LCD colocado na parte inferior do tacômetro. Os ajustes e acabamentos estavam acima de seus concorrentes. Como era uma perua, era normal apresentar um banco traseiro rebatível.

Para o compartimento do motor, a Volkswagen instalou uma variedade de motores a gasolina e diesel variando entre 60 cv e 100 cv. Uma novidade importante foi a unidade diesel de 1,9 litro com injeção direta de combustível, que proporcionou uma grande eficiência de combustível.