A Mercedes-Benz atualizou sua linha CLK em 2005 para ambas as versões: o cupê e as versões conversíveis para cumprir os regulamentos de emissões Euro 4.
Junto com o facelift, o carro recebeu algumas mudanças em seu visual.
A marca de estrela de três pontas não tinha um conversível adequado do Classe E depois que aposentou a versão W124 em 1997. Ela o substituiu pelo CLK, que era baseado na plataforma do Classe C, mas com elementos de design do Classe E . Em 2003, a montadora apresentou a segunda geração do CLK, que foi reformulada em 2005.
O modelo de 2005 manteve uma forma semelhante para os faróis, com duas lâmpadas arredondadas de cada lado. Comparado com a versão de 2002, eles tinham lentes transparentes. A grade recebeu três ripas em vez de quatro como na versão sem facelift. As lanternas também foram redesenhadas. Ambos os para-choques receberam um novo design. Seu soft-top preto apresentava uma janela traseira de vidro descongelado.
O interior foi aprimorado com a introdução do novo sistema de infoentretenimento COMMAND 2.0, que apresentava um sistema de navegação baseado em DVD. Também permitia a integração do iPod através de uma porta externa instalada no porta-luvas. O design da pilha central foi modificado e os comandos anteriores do Classe C foram substituídos por novos.
Sob o capô, o CLK foi oferecido com opções de motores a gasolina e diesel variando entre 150 cv e 388 cv. Além dos motores básicos (diesel de 150 cv, unidades a gasolina de 163 cv e 184 cv), todas as outras versões receberam a nova caixa de câmbio 7G-Tronic.