Skoda обновила модельный ряд Yeti в 2013 году, радикально улучшив его внешний вид и модернизировав двигатели в соответствии с новыми европейскими стандартами загрязнения окружающей среды.
Введение европейских стандартов загрязнения окружающей среды Euro 5b в январе 2013 года заставило больше автопроизводителей улучшить свои автомобили. Дело было не только в выбросах двигателя. Речь шла также о системах безопасности и коэффициенте утилизации автомобилей. Skoda все равно пришлось улучшать Yeti после четырех лет на рынке, и это было скорее преображение, чем просто макияж.

В то время как его предшественник отличался отчетливыми противотуманными фарами, окруженными отдельной группой рядом с фарами, Yeti 2013 года появился с совершенно новой передней панелью. Их тема дизайна в кубистическом стиле с прямоугольными фарами и ярко выраженным видом щитка днища придала кроссоверу более смелый вид. Почерневшая задняя стойка и дверная рама делали автомобиль похожим на пикап с более длинной оконной панелью. В задней части чешский автопроизводитель изменил дизайн задних фонарей с четкими линиями, которые образовали букву C от «Clever».

Внутри Yeti отличались небольшими обновлениями приборной панели и новым рулевым колесом с большим количеством кнопок и полой нижней спицей (в зависимости от уровня отделки салона). Благодаря новой информационно-развлекательной системе автомобиль мог быть оснащен камерой заднего вида.

Для Skoda Yeti 2013 года выбрали четыре дизельных и три бензиновых мотора — все с турбонаддувом и с непосредственным впрыском. Спектр производительности варьировался от 1.2 TSI мощностью 105 л.с. до 2.0 TDI мощностью 170 л.с. Передний или полный привод пятого поколения с муфтой Haldex устанавливался в зависимости от характеристик двигателя.

Впервые представленный чешским автопроизводителем в качестве концептуального исследования в 2005 году, Skoda решила подтолкнуть Yeti к серийному производству.
Во второй половине 2009 года на рынке появится новый небольшой внедорожник от Skoda, оснащенный двумя бензиновыми двигателями и тремя дизельными агрегатами, все они соответствуют нормам выбросов ЕВРО-5. Его название пытается предположить, что маленький внедорожник способен добраться до любой местности, поскольку, по слухам, мистическое существо Йети живет в высокогорных местах. Skoda Yeti конкурирует с другими небольшими внедорожниками, такими как Hyundai Tucson, Kia Sportage, Nissan Qasqai и Suzuki Grand Vitara.