En avril 2016, Audi a présenté la gamme A3 actualisée et, avec le reste de la gamme, le constructeur automobile allemand a également mis à niveau la S3.
Depuis le début, c’était l’une des voitures à hayon les plus chaudes du marché, et elle offrait un système de traction intégrale. Au fil du temps, tandis que la gamme A3 évoluait, la S3 était constamment améliorée. La troisième génération de l’A3 a été rafraîchie en 2016 et, deux décennies après la première génération.

La S3 était proposée en quatre versions de carrosserie : hayon à 3 ou 5 portes, cabriolet et berline. Un nouveau carénage avant a été introduit, avec une calandre à cadre unique plus haute entre les phares à LED standard. Il y avait une paire de prises d’air pour refroidir les freins sur les côtés, et ce n’était pas seulement pour le spectacle. La S3 arborait le logo S des étriers de frein aux jantes en alliage léger de 18 pouces au design unique. Un aileron de toit discret se trouvait au-dessus du hayon (pour les versions à hayon), et quatre échappements, pas si discrets, étaient affichés sous le pare-chocs.

À l’intérieur, la S3 comportait des logos S sur le volant à fond plat, les seuils de porte, les sièges et le levier de vitesses. Deux sièges baquets à l’avant offraient un bon soutien dans les virages. Selon les options, le groupe d’instruments pourrait comporter l’affichage numérique Audi Virtual Cockpit. L’unité d’infodivertissement MMI (Multi Media Interface) était installée de série.

Bien qu’elle n’ait pas à se plaindre du moteur de 300 ch offert sur son prédécesseur, la S3 2016 offrait 10 ch de plus. Il était couplé de série à une boîte manuelle à 6 vitesses pour la berline 3 portes. Sur certains marchés, comme le Royaume-Uni, la version 5 portes et la berline étaient équipées d’une boîte de vitesses S-Tronic automatique à 7 rapports (double embrayage).