Выпуск модели с фейслифтингом в 2002 году принес несколько внешних модификаций кузова, а также внутренних.
Версия HDI с Common Rail была добавлена для дизельного двигателя 1.9, а также некоторые версии HDI бензиновых двигателей 1.4, 1.6 и недавно добавленных двигателей 2.0.

Стремление к более чистым двигателям вынудило Peugeot сократить выбросы, оснастив свои автомобили более качественными фильтрами твердых частиц и каталитическими нейтрализаторами, и в этом отношении новый 206 был менее загрязняющим окружающую среду, чем предыдущий. Отзывчивый и безопасный, 206 также получил 4 из 5 звезд за безопасность взрослых пассажиров в тестах EuroNCAP.

У Peugeot была богатая гоночная история и много титулов на полке, когда она решила построить один из последних безнаддувных, механических коробок передач, легких и маневренных автомобилей из своей линейки: 206 RC.
Война хот-хэтчей частично переместилась из компактного сегмента в супермини. Renault Clio Renault Sport пробудил к нему аппетит, а следующим на очереди был Peugeot. Примерно в то же время Honda Civic Type R выпустила версию EP3 с кричащим двигателем на 8000 об/мин и мощностью 200 л.с. Но это было слишком дорого, поэтому европейцам пришлось выбирать между французскими марками двигателей без наддува. Все остальные были с турбонаддувом.

Снаружи маленький 206 RC (или GTI 180, как его называли в Великобритании) отличался более длинным спойлером на крыше, чем у обычного 138-сильного GTI. Спереди нижний фартук был немного изменен, чтобы выглядеть более агрессивно. Новый комплект 17-дюймовых легкосплавных дисков дополнил спортивный пакет. Он был доступен только с 3-дверным кузовом, как и его знаменитый предок 205 GTI.

Интерьер был более вдохновлен гонками, чем другие автомобили Peugeot. Спортивные ковшеобразные сиденья Recaro имели нерегулируемый подголовник и отверстие для ремней безопасности, хотя гоночных ремней не было. Но это выглядело хорошо. Алюминиевые педали и рукоятка рычага переключения передач подчеркивали «колоритный» вид автомобиля. Автопроизводитель установил на 206 RC короткую манетку.

Сердцем автомобиля стал 2,0-литровый атмосферный двигатель с изменяемыми фазами газораспределения и измененными впускным и выпускным коллекторами. Он сочетался со стандартной 5-ступенчатой коробкой передач. Четырехколесные тормозные диски устанавливались в стандартной комплектации.

Модель 106 освежила модельный ряд Peugeot, став в конечном итоге самым продаваемым автомобилем производителя.
На момент запуска в 1998 году хэтчбек был доступен в 3- и 5-дверном вариантах с тремя бензиновыми двигателями (1,1, 1,4 и 1,6 л) и одним дизельным двигателем объемом 1,9 л. С точки зрения инженерии, 206-й был избавлен от использования старой платформы 106-го, поскольку был оснащен совершенно новой. Построенный на двух заводах в Мюлузе (Франция) и Райтоне (Великобритания), 106-й быстро завоевал популярность, особенно благодаря привлекательному внешнему виду автомобиля, общей надежности и доступности.