Die zweite Generation des Lexus IS wurde im März 2005 auf dem Genfer Autosalon vorgestellt.
Sie richtete sich direkt an die Premium-Limousinen wie den BMW 3er und die Mercedes-Benz C-Klasse.

Mit dem Modell von 2005 versuchte der IS, sich einen größeren Marktanteil zu sichern. Die Premium-Marke von Toyota verfügte bereits beim Basismodell über eine lange Liste von Standardfunktionen, die über Bluetooth-Konnektivität und einen Motorstartknopf verfügten. Der IS wurde auf der Toyota N-Plattform gebaut, die für heck- oder allradgetriebene Fahrzeuge verwendet wurde.

Das Äußere wurde im japanischen Stil mit einer Mischung aus geschwungenen und eckigen Formen gestaltet. Die Frontpartie wirkte mit all ihren Elementen wie nach hinten gekehrt, angefangen beim trapezförmigen Kühlergrill bis hin zu den Scheinwerfern. Die ansteigende Gürtellinie endete an den Rücklichtern.

Das Interieur des Lexus IS war in Sachen Design nicht so inspiriert wie das Exterieur. An seinem Aussehen war nichts auszusetzen, aber auch nichts Ansprechendes. Die Sitzposition auf den Vordersitzen war höher als in einem BMW 3er. Hinten war Platz für zwei Erwachsene. Der massive Getriebetunnel war zu groß, um eine dritte Person bequem unterzubringen. Die Rücksitzlehne konnte nicht umgeklappt werden, um den Kofferraum zu erweitern, der nicht so groß war wie bei seinen Konkurrenten.

Auf der Motorseite wurde der IS mit einer Auswahl von zwei Benzinern eingeführt. Später waren weitere Optionen verfügbar, darunter ein 2,2-Liter-Diesel für den europäischen Markt. Ein 6-Gang-Schaltgetriebe war für den größten Teil der Baureihe serienmäßig eingebaut, und eine 6-Gang-Automatik war optional erhältlich.