BMW lanzó una nueva generación de la Serie 3 Coupé en 1999, basada en la última plataforma E46 del fabricante alemán.
El diseño exterior del cupé sufrió cambios importantes en comparación con su modelo de generación anterior, con un chasis más largo, una parrilla delantera revisada, un nuevo alerón (con tomas de aire más grandes) y faros rediseñados.

Además, el Serie 3 Coupe presentó una suspensión más rígida que su contraparte sedán y desafió al Mercedes-Benz CLK y al Volvo C70 en el segmento de cupé premium. Algunas de las nuevas características instaladas en este Coupé Serie 3 de 1999 incluyeron Control Automático de Estabilidad con Tracción (ASC+T) y Control de Frenado en Curvas (CBC). Este modelo recibió un ligero rediseño en 2003, con nuevos guardabarros, parachoques delantero y luces delanteras y traseras.

En comparación con su predecesor, el E36, el E46 se construyó sobre un chasis más largo y, en general, el automóvil era más largo, más ancho y más bajo, cambios que hicieron que el automóvil fuera aún más estable y potente.
El equipamiento de seguridad incluía airbags frontales duales, airbags laterales y airbags de cortina para los pasajeros delanteros, así como ABS, ESC, control de tracción, control de frenado en curvas y distribución electrónica de la fuerza de frenado.

El cupé E46 se ofreció con 5 motores en 1999-2000, todos de gasolina. (2,2 litros, 2x2,5 litros, 2,8 litros y 3,0 litros). La potencia osciló entre 125 kW y 170 kW y los motores estaban acoplados a una transmisión manual de 5 velocidades o automática de 5 velocidades.