A BMW lançou uma nova geração do Série 3 Coupe em 1999, baseado na mais recente plataforma E46 do fabricante alemão.
O design exterior do cupê passou por mudanças importantes em relação ao modelo da geração anterior, apresentando chassi mais longo, grade frontal revisada, novo spoiler (com entradas de ar maiores) e faróis redesenhados.

Além disso, o 3 Series Coupe apresentava uma suspensão mais rígida do que o sedã e desafiou o Mercedes-Benz CLK e o Volvo C70 no segmento de cupê premium. Alguns dos novos recursos instalados neste Coupe da Série 3 de 1999 incluíam Controle Automático de Estabilidade com Tração (ASC+T) e Controle de Freio em Curvas (CBC). Este modelo recebeu uma ligeira remodelação em 2003, apresentando novas asas, pára-choques dianteiro e luzes dianteiras e traseiras.

Comparado ao seu antecessor, o E36, o E46 foi construído em um chassi mais longo e, no geral, o carro era mais longo, mais largo e mais baixo, mudanças que tornaram o carro ainda mais estável e mais potente.
Os equipamentos de segurança incluíam airbags frontais duplos, airbags laterais e airbags de cortina para os passageiros da frente, bem como ABS, ESC, controle de tração, controle de freio em curva e distribuição eletrônica da força de frenagem.

O cupê E46 foi oferecido com 5 motores em 1999-2000, todos a gasolina. (2,2 litros, 2x2,5 litros, 2,8 litros e 3,0 litros). A potência variou de 125 kW a 170 kW e os motores foram acoplados a uma transmissão manual de 5 velocidades ou uma transmissão automática de 5 velocidades.