SEAT a présenté la première génération de la Cordoba en 1993 et, six ans plus tard, elle a rafraîchi toute la gamme, qui se composait d’un coupé à deux portes, d’une berline à quatre portes et d’un break.
Habituellement, un constructeur automobile rafraîchit un véhicule après quatre ans sur le marché. SEAT traversait des moments difficiles. Comme il appartenait au groupe Volkswagen, il devait se conformer aux directives allemandes. En fin de compte, ces décisions se sont avérées précieuses.

Le modèle de 1999 a présenté un nouveau design, qui a conduit à des bords plus doux et à des lignes courbes sur la carrosserie. Ses phares arboraient une courbe sur leur face supérieure, tandis que son prédécesseur en présentait des rectangulaires. À la recherche de son image de marque individuelle, le constructeur automobile a introduit un nouveau badge à l’avant, entouré d’un élément de pare-chocs de la couleur de la carrosserie. La version berline présentait un coup de pied intéressant derrière les portes arrière et de petites vitres latérales triangulaires. Son couvercle de coffre haut et son porte-à-faux arrière court donnaient à la voiture une apparence sportive, malgré sa taille et ses proportions de petit segment.

À l’intérieur, le constructeur automobile a introduit un tout nouveau tableau de bord avec une meilleure intégration du système de ventilation et des évents lisses au-dessus de la console centrale. À l’intérieur du groupe d’instruments, SEAT a adopté le style de Volkswagen pour les cadrans, avec les jauges de température et de carburant installées au milieu et sur la partie supérieure du panneau.

Sous le capot, SEAT a installé une gamme de moteurs plus étroite par rapport à sa version non rénovée. Cela s’est produit après que la direction a remarqué que les clients demandaient rarement des moteurs plus puissants.