Embora as regras e regulamentos europeus proibissem o Zonda R de ser registrado para vias públicas, um revendedor de Hong Kong insistiu que a montadora construísse uma série especial apenas para eles.
Pagani construiu apenas cinco (cinque – cinco em italiano) unidades do Zonda Cinque especial. Era mais leve, mais potente e mais rápido que o Zonda F. A montadora começou com o Zonda F e usou a maioria das tecnologias de corrida dele, mas adaptadas para uso em estrada.

Na frente, o Zonda Cinque apresentava um spoiler de lábio adicional sob o avental, o que aumentava a força descendente. Nos pára-lamas dianteiros, ambos os carros apresentavam saídas de ar para extrair o ar preso dentro do poço da roda, mas no Cinque estava com quatro ripas transversais de fibra de carbono. Uma entrada de ar montada no teto aumentou a altura do carro enquanto alimentava o grande motor com mais ar fresco. Toda a carroceria foi construída com um material especial chamado carbo-titânio, que incorporou titânio dentro dos painéis de fibra de carbono para aumentar a resistência.

No interior, a montadora instalou um interior inspirado em corridas com bancos de fibra de carbono, guarnições e painéis de porta. Como ainda era um veículo projetado para uso rodoviário, a Pagani instalou um aparelho de ar condicionado e um sistema de som no console central. A montadora não instalou o exclusivo volante coberto de Alcântara com airbag.

A Pagani ofereceu as cinco unidades do cupê Cinque com um motor V-12 AMG de 7,3 litros reajustado. Ele bombeou 76 pôneis a mais do que o Zonda F regular. Ele foi emparelhado com uma caixa de câmbio sequencial de seis velocidades exclusiva, que o motorista poderia controlar através dos paddle-shifts atrás do volante ou pela alavanca de câmbio.