В то время как европейские правила и положения запрещали регистрацию Zonda R для дорог общего пользования, гонконгский дилер настоял на том, чтобы автопроизводитель создал специальную серию специально для них.
Pagani построил всего пять (cinque — пять по-итальянски) особенных Zonda Cinque. Он был легче, мощнее и быстрее, чем Zonda F. Автопроизводитель начал с Zonda F и использовал большинство гоночных технологий оттуда, но адаптировал для использования на дорогах.

Спереди у Zonda Cinque был дополнительный спойлер под фартуком, который увеличивал прижимную силу. На передних крыльях у обеих машин были вентиляционные отверстия для удаления воздуха, попавшего в нишу колеса, но у Cinque было четыре поперечных ламели из углеродного волокна. Установленный на крыше воздухозаборник увеличил высоту автомобиля, в то же время снабжая большой двигатель большим количеством свежего воздуха. Весь кузов был изготовлен из специального материала под названием карботитан, в состав которого для повышения прочности входил титан внутри панелей из углеродного волокна.

Внутри автопроизводитель установил гоночный интерьер с каркасами сидений, отделкой и дверными панелями из углеродного волокна. Поскольку это все еще был автомобиль, предназначенный для использования на дорогах, Pagani установила кондиционер и аудиосистему на центральной консоли. Автопроизводителю не подошёл уникальный, обтянутый алькантарой руль с подушкой безопасности.

Pagani предложил пять единиц купе Cinque с перенастроенным 7,3-литровым двигателем V-12 AMG. Он выдавал на 76 лошадиных сил больше, чем обычная Zonda F. Он был соединен с уникальной шестиступенчатой секвентальной коробкой передач, которой водитель мог управлять с помощью подрулевых лепестков за рулем или рычагом переключения передач.